Makrofyta jsou důležitou součástí vodních ekosystémů a jsou proto významná pro hodnocení jejich ekologického stavu.Využití makrofyt jako indikátorů ekologického stavu stojatých vod je kromě jejich důležité ekologické role založeno také na skutečnosti, že určité druhy či skupiny druhů jsou indikátory specifických typů stojatých vod a antropogenní zatížení ovlivňuje druhové složení společenstev těchto stojatých vod. Nejen přítomnost, ale také absence makrofyt na stanovišti má indikační hodnotu.